Основные цели создания Федерального регистра медицинских работников и Федерального реестра медицинских организаций:

 Обеспечение единой федеральной информационной базы данных о медицинских работниках системы здравоохранения Российской Федерации;

 Создание инструментов для мониторинга, анализа и стратегического планирования кадровых ресурсов в сфере здравоохранения на уровне субъекта Российской Федерации (для органов государственной власти субъектов Российской Федерации) и в целом по Российской Федерации (для Министерства здравоохранения Российской Федерации);

 Создание инструментов для сбора и анализа сведений в части кадрового обеспечения медицинских организаций;

 Предоставление медицинским организациям инструментов ввода, актуализации и учета сведений о кадровом обеспечении в соответствии с требованиями федерального органа исполнительной власти.